#source/youtube#human-behaviorism#robert-sapolsky
first discplinary leap, sekarang pindah materi ke molecular genetic.
about how evolution work on molecular level. this will rip appart heretibility im assuming (notion/dasar dari behavioral evolution)
dosen e trashing behavior evolution, and im kinda tersinggung haha. kek aku wes bought that idea, dan sekarang dibilang idea ne jelek. iku mungkin seng dee peringatkan bahaya di bagian intro
basic DNA
diawal akeh review tentang
- what is DNA
- cara kerjae
- gunae dee. gunae yo intie gae nge code kabeh stuff protein, and itu powerful soale uakeh hal nde badan e kene dari protein. enzim, struktur selmu, opolah.
changes in code e isa ngubah bentuk enzim dan yo berubah kabeh. perubahan iki terjadi karena,
mutasi
ada seng micromutation, terjadi nek 1 huruf dari triplet seng terganti(point mutation). seperti yang udah aku ketahui dari SMA, ada banyak triplet macem seng ngekode buat satu amino acid*(karena ada 60 an macem kombinasi basa DNA, tapi protein seng dikode mek 20 an)*.
tingkat keparahan point mutation
-
so if the mutation ternyata masih ngekode hal seng sama, then good, nothing changes in the output.
here’s new things, katae biasane ini terjadi nde letter tengah, jadi letter tengah dari 3 letter itu kalo berubah, biasane gk ngefek ke asam amino seng di buat.
-
sometimes perubahan 1 huruf iki ngaruh ke asam amino seng dikode(biasanae letter depan belakang, bkn tengah), and even if that happen, sometimes itu gk ngaruh pisan soale asam amino e relatif mirip dan gk ngubah something major (i dont understand it really, kok bisa mirip, bentuknya kek ato apanya kek dan masak gk ngaruh blas seh, but it make sense lah)
-
ada pisan deletion, dan iki ngerusak kabeh protein seng dikode setelah e. so i guess this is major. ada pisan insertion, major pisan. triplet e jadi nggeser kabeh lah. ABC DEF jadi ABB CDE ato jadi ABD EFG
💡 sometimes point mutation is major pol, sometimes it somewhat doesn’t change anything
contoh mutasi (yg ngaruh/berkonsekuensi. ya iyalah, kalo gk kan kita gatau)
- ada chemical namae phenylalanine, ada dibadan tapi gabole banyak2. tros ada enzim seng ngubah iku jadi something safer. if ada mutasi di enzim itu, tros enzim e gk iso ngelakuin tugas, akhire kebanyakan dibadan. disease e namae PKU, phenylketonuria. common. akhire dead.
- contoh lain. ada yg namae TFM, testiscular feminization syndrome. intie orang e lanang(xx) tapi fenotype e(karakter fisik yang isa mbo liat, yg berasal dari kode genetik2 an mu, genotype) e cewe. nama lain e androgyne disensitivity. iki mutasi yang terjadi di androgen receptor, testosterone receptor(rasae androgen itu kek family hormon sex, dengan salah satu yg major itu testosterone). akhire testosterone masio akeh tpi gk iso di baca dan jadilah ‘cowo tapi fisik e kek cewe’.
- contoh lagi. ada yg mirip TFM, tapi receptor e bkn sampe gk guna, tapi jadi lebih gk efektif ae. akibat e wong e pas jek cilik iku wedok, pas mari puber, testosterone lebih akeh dan akhire cukup gae ngetrigger something lah, untuk dikategorikan jadi lanang mbe badane, akhire berubah secara fisik jadi lebih mirip lanang.
- kepikiran ae, bkn dari video
is mutation a mistake or a feature?
mutasi2 seng ngubah protein2 an iki cocok mbe gradualism.
ada organisme seng lebih sangar dalam reproduksi, mek sekedar 1% better, ngkok sue2 kabehe punya. gitu teros perlahan2 mengubah suatu spesies jadi lebih baik. gradualism.
here’s the cool part, kene iso ngecek perubahan 1 basa dalam gene, tros isa ngira2, “oh gene ininya manusia paling mirip mbe hewan iki. kalo sama hewan itu, beda jauh”, iso gae ngukur relativeness ngono secara spesies, seberapa dekat kita dengan hewan A dalam segi morfologi kek.
iki contoh pemanfaataan tracing iku. ada seng namae fox P2. iki have something to do with language, and every animal has it. kita liat2 punyae akeh hewan dan kita bandingin, and turns out, punya mreka relatif mirip satu sama lain, kuda mbe burung, anjing mbe kucing. tros punya e manusia iku beda dewe.
kek cool ae, seakan2 setuju dengan fakta bahwa kita lebih sophisticated dalam berkomunikasi antar individu.
intermezzo
“manusia gen e podo mbe monyet 98%”
“kene mbe sodara kandung gen e podo 50%”
kok aneh? ngene,
intie nek kene ngomong antar spesies, iku kene ngerefer mbe “gene type” jadi kene ndue gen seng podo2 nge code tangan, podo2 ngecode ginjal, dkk.
nek dalam spesies, kene ngerefer mbe varian dalam tipe tersebut. jadi kene punya varian seng sama dalam type tangan. rosoe seng iki ngerefer ke “gene e ngeplek, basa triplet e persis”
lanjut,
iku lak cocok mbe gradualism, tros ada yg gk setuju, gould sama niles. mreka setuju e seng punctuated equilibrium.
kenapa?
jadi mereka paleontologist/geologist. mreka belajar fossil e snail dan mereka ngeplot seberapa keren spesies terhadap waktu, jadie graph seng kek tangga ngono(yo punctuated equilibrium, angel nulis e, sebut ae graph tangga).
graph punctuated equilibrium
💡 kalo itu yg bener, artie “kompetisi antar individu gk ngaruh, aku kalo punya satu trait seng lebih sangar dibandingno laine, kek 1 persen better, bukan berarti generasi selanjute bakal punya iku”. (dipeker2 masok akal se, masio aku sangar dalam reproduksi tapi gk iso tempur, lak yo mati, gimana carae ben iso kabehe generasi dibawahku iku harus somewhat my blood line?)
new word, asinine = stupid
oke, graph tangga tros diserang.
ini argumen e, “iku lak perubahan fisik tok seng isa mbo liat, padahal evolusi kan gk mek fisik”, which i agree bcos kita yo gk berubah banyak secara fisik, tapi kita tetep berevolusi(yakan(?), aku gaero seh definisi evolusi, but there’s something different lah manusia dulu mbe sekarang, dari non fisik e).
iki argumen seng dosen e suka,“tunjukno perubahan kek gitu dalam tingkat gene”. dan yo gaiso, mreka mek isa liat morphology e.
how kode tertulis
(btw iki model e kek narasi, soale yo dee njelasno e kek teori seng berjalan seiring waktu, seiring dengan discovery seng ditemukno orang, kek kronological ngono)
dna iku mengode protein dengan terpisah2. jadi bkn one long strand untuk 1 protein, tros baru lanjut protein lain. tapi 1 protein iku kode e dibagi2, misal 1/3 bagian di kode, trus ada seng gk dipake, tros bagian dua dari 1/3.
contoh DNA
----++++++------+++++++-----
--- itu 1/3 kode suatu protein A
++++ itu bkn bagian dari protein A
tros mbikin e yopo nek kepisah2 gitu?
DNA e jdi RNA , tros ada enzim splicing seng motong bagian seng gk dipake(++++, namae intron. kalo seng ----, aka bagian dari protein namae exon. kek exon 1, exon 2), tros exon 1 dan exon 2 dan exon 3 digabung, barulah dikode jadi protein.
why? kenapa kok dipisah2 gitu?
one gene, one protein.
ini pemahaman dulu. satu gene cuman gae ngecode satu macem protein.
one gene many protein.
ini seng di enable sama ‘modular’ protein iki, protein seng terpisah jadi beberapa exon. kon isa ngatur splicing enzim buat motong at different part, dan akhire
💡 kon isa punya 1 gene seng iso gae ngecode banyak protein.
contoh DNA
123456
splicing gene A bisa motong jadi 123 456
splicing gene B isa motong jadi 12 3456
tros waktu exon2 iki digabung2 lagi, jadilah macem2 protein seng berbeda.
new word , flabbergast. artie astonish, surprise.
so apakah yg tertulis di DNA? apakah 99% tentang asam amino?
jawabane 5% asam amino.
95% sisae itu ‘intruction booklet’, when to produce that protein.
visualisasi e liaten lebih lengkap e nde video e around 1 jam 10 menit kebelakang.
intie ngene lah seng tak tangkep,
- DNA punya promoter, yaitu on off/trigger, trigger untuk menentukan when to produce the RNA sampe akhire jadi protein.
- promoter iki kek receptor, seng di trigger dari outside world.
- one DNA strand can have many promoter, and many strand can have the same promoter.
contoh efek dari beberapa promoter dalam satu strand dan beberapa strand yang memiliki promoter yang sama.
DNA strand A punya promoter p, q
DNA strand B punya promoter q, r,s
DNA strand C punya promoter r.
misal ada trigger buat promoter r, ngkok seng kerja berarti strand B sama C. kalo ada trigger p, yg kerja cuman A.
jadi, satu trigger iso ngehasilin protein tertentu, dari different strand. dee nyebut e “different transcription factor can activate entire networks of gene expression”. disebut network mungkin karena ada banyak strand
ada satu point seng ditekanin mbe dee, ‘trash the point about DNA know what its doing, mreka itu nunggu instruction dari luar’
dee mayan menekankan hal itu, sadar ae, mungkin itu penting banget.
so this introduce the word ’environment‘.
Cell e mek nerima transcription factor dari luare dee, seng ngetrigger pembuatan apapun itu yg pake DNA.
💡 cell iku ngelakuin tindakan berdasarkan input dari environment e dee.
iki keren lah, menunjukkan adanya interaksi antara cell dengan environment e. jadi semua hal e itu aslie di atur mbe event nde luar cell, cell e mek kek ‘robot’ ae.
contoh ‘reaksi’-cell yang disebabkan oleh environment
dikasi contoh tentang how DNA regulated by hormon, ato dari outside world.
mulai 1.20.44. sapatau butuh visualisasi(soale rosoe angel njelasno e).
coba tak bikin tulisan,
ngene step by step e dari environment sampe dalem cell
- something bind on the surface of a cell
- bind iki ngetrigger something di dalem cell e, sampe ada transcription factor seng nge trigger promotor e dan
- terbentuklah RNA hingga protein.
apa yang ke bind nde luar cell? contoh e hormon.
this is quite amazing.
biasane nek ngomong,” hormon iki nge produce this chemical”, mek nerima ae, oke masuk akal gitu. skarang dapet insight mengenai yang sebenarnya terjadi dalem cell
💡 yg keren juga, fakta bahwa that hormon isa ae dari tempat seng sangat jauh di badan dari cell seng diaktifno.
let’s push it even more
isa ae dari luar badan. contoh sensory smell, pheromone, ngebind nde idung, tros yo kayak hormon. bener’e itu kayak “hormon dari luar badan”.
- btw , ini definisi hormon
bloodborne chemical messenger. mreka itu messenger, pembawa pesan, pembawa perintah, penyuruh, pentrigger. keren ae menurutku definisie, ntah keren dimana e tpi haha.
💡 environment regulate what gene does
lanjut materi dalam bentuk narasi lagi,
ada yg namae chromatin. dosen e ngambar e kek shield nde luar e DNA, buat ngasih struktural rigidity gitu. nah, biar transcription factor e isa ke DNA, chromatin e harus ‘mbuka’.
💡 this whole world of chromatin mbuka nutup itu urusan epigenetic, tentang ngatur kapan gene beraksi tanpa ngubah gene e dewe.
ada istilah gene silencing
nek chromatin e gaiso ‘mbuka’, endinge gen e gaiso berubah jadi protein, render it useless, dee gk kepake. chromatin yg gaisa mbuka itu salah satu skenario yang berujung gene silencing.
kapan itu terjadi?
iki iso terjadi nde anak2. waktu development, environment mu ngatur chromatinmu. jdi kek keluarga mu mbok bapakmu, iku punya impact gae ‘memutuskan’ mau nge silence gene mu ato nggak. iki bertahan lama(eventho gk bener2 selamane kata dosen e, tapi untuk sekarang anggep ae selamae). jdi masa pertumbuhanmu itu ngaruh ke epigenetic iki.
keren ae,
💡 ternyata masa development anak itu ngaruh sungguan ke individu, bahkan dari DNA isa keliatan
fertilization is about genetics, development is about epigenetics.
mbacae ngene mungkin, ‘fertilisasi iku seng ngaruh ke genetic, development iku seng ngaruh ke epigenetic’
(notice im using the word DNA and gene karep2ku, aku jek bingung mana seng mana, bedae apa. angggep en ae kabehe iku strand of triplet, rosoe iku aman)